В настоящее время больница представляет собой современное многопрофильное лечебно - профилактическое учреждение на 776 коек. В состав ГУ «НОДКБ» входят: стационар (8 педиатрических и 9 хирургических отделений), консультативно-диагностический центр на 400 посещений в смену, развернут стационар краткосрочного пребывания на 20 коек, клинико-диагностическая лаборатория. На базе ГУ «НОДКБ» функционируют: кафедра факультетской и поликлинической педиатрии, кафедра педиатрии и неонатологии ИПО, кафедра детской хирургии, кафедра клинической фармакологии, курс детской неврологии. За год через консультативную поликлинику проходит более 250000 человек, в стационаре получают лечение более 15000 детей. В штате больницы 1236 сотрудников, в том числе 302 врача, 475 человек среднего медицинского персонала. 80% врачей имеют квалификационную категорию, 11 сотрудников - кандидаты медицинских наук, 1 доктор медицинских наук.